换一批基于转录组测序的红树莓bHLH转录因子家族鉴定及分析
Identification and analysis of bHLH transcription factor family in red raspberry based on transcriptome sequencing
摘要bHLH转录因子是植物中数量较大的一类转录因子家族,在植物的生长发育、次级代谢调控、激素响应等方面发挥着重要作用.红树莓果实中含有丰富的树莓酮,为了深入探究bHLH转录因子在红树莓生长发育及树莓酮合成过程中的作用,该研究基于'波尔卡'和'橙色传奇'2 种红树莓果实的转录组测序,鉴定了红树莓bHLH基因家族成员,并对这些基因进行生物信息学分析.结果表明:(1)红树莓果实中共鉴定到 95 个bHLH转录因子家族成员.(2)红树莓的bHLH转录因子家族成员多数为不稳定蛋白;超过半数成员定位于细胞核.(3)bHLH转录因子N端包含保守的His5-Glu9-Arg13 序列,C端包含保守的Leu序列.(4)系统发育树将该家族成员分为 20 个亚家族,其中R亚家族成员最多,有 12 个.(5)表达模式图表明bHLH转录因子在青果期表达量较高,成熟期表达量较低.该研究结果为筛选与树莓酮含量变化一致的bHLH转录因子提供了依据,为进一步探究红树莓bHLH家族的功能提供了参考.
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关键词
红树莓转录组测序bHLH转录因子基因家族树莓酮red raspberry(Rubus idaeus)transcriptome sequencingbHLH transcription factorsgene familyraspberry ketone
分类号
Q943
栏目名称
DOI
10.11931/guihaia.gxzw202304061
发布时间
2024-10-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
北京市属高等学校高水平教学创新团队建设支持计划项目（BPHR20220211）
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