换一批摘要为探究西南牡蒿(Artemisia parviflora)的叶绿体基因组结构特征及其系统位置,该研究利用高通量测序技术对其进行测序,并借助生物信息学工具进行分析.结果表明:(1)西南牡蒿叶绿体基因组长151 047 bp,呈现为由 4 部分组成的环状双链结构,GC含量为 37.5%.(2)共注释 115 个基因,包括 81 个蛋白编码基因、4 个rRNA基因及 30 个tRNA基因.(3)检测到 68 个简单重复序列(SSRs)和 37 个长重复序列.(4)西南牡蒿叶绿体基因组的密码子使用偏性较弱,其主要受自然选择的影响,高频密码子偏向以A/U结尾.(5)西南牡蒿叶绿体基因组的 IR 区未出现明显的扩张或收缩;筛选出了 trnH-psbA、rpl16-rps3、ycf15-trnL-UAG、ndhA和ycf15 个高变异区域,可作为鉴定龙蒿亚属植物的潜在分子标记.(6)系统发育分析揭示了西南牡蒿在龙蒿亚属中的系统位置及蒿属内各亚属的系统发育关系.该研究为蒿属植物后续的分子标记开发和系统发育研究提供了参考.
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关键词
西南牡蒿叶绿体基因组密码子使用偏性分子标记系统发育分析Artemisia parviflorachloroplast genomecodon usage biasmolecular markersphylogenetic analysis
栏目名称
DOI
10.11931/guihaia.gxzw202310052
发布时间
2024-10-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
云南省基础研究专项青年项目（202001AU070017）
大理大学博士科研启动费项目（KY2096107540）
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