凹脉金花茶的遗传多样性和群体遗传结构分析
Analysis of genetic diversity and population genetic structure of Camellia impressinervis
摘要为进一步了解极小种群物种凹脉金花茶(Camellia impressinervis)的遗传多样性和群体遗传结构,该研究采用基因分型测序技术(GBS)对广西分布的4个居群56份凹脉金花茶样品进行简化基因组测序,并对其遗传多样性和群体遗传结构等进行分析.结果表明:(1)从56份凹脉金花茶样本中获得高质量单核苷酸多样性(SNP)位点4 014 956个,Q20和Q30的平均值分别为98.74%和95.35%,GC含量分布范围为41.70%~45.67%.(2)下雷陇恒居群(CI-LH)的期望杂合度(He=0.201 4)、核苷酸多样性(Pi=0.211 7)、近交系数(Fis=0.126 1)最高,弄岗卜那居群(CI-BN)的观测杂合度(Ho=0.171 6)、核苷酸多样性(Pi=0.180 3)、近交系数(Fis=-0.023 0)最低,群体间基因流强度(Nm)的范围为1.151 3~4.557 7,平均值为2.212 2.(3)聚类分析、主成分分析与居群遗传结构分析表明,56份凹脉金花茶可被分为4个类群.综上认为,凹脉金花茶具有中等程度的遗传多样性和遗传分化水平,建议加强对CI-BN居群的就地保护,在条件成熟的情况下实施回归引种,以实现其居群恢复和扩大.此外,加强栖息地保护以及禁止人工挖掘对于保持其遗传多样性至关重要.该研究结果为凹脉金花茶的遗传保育和有效保护提供科学依据.
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