太白贝母种子低温萌发过程中C3H基因家族鉴定及表达分析
Identification and expression analysis of C3H gene family during low-temperature germination of Fritillaria taipaiensis seeds
摘要为解析C3H基因在太白贝母种子萌发过程中的作用,基于低温萌发转录组数据,该研究通过生物信息学的方法对太白贝母C3H基因家族进行系统鉴定及表达分析,筛选出5个低温高表达候选基因并解析其对赤霉素(GA3)和脱落酸(ABA)的响应机制.结果表明:(1)C3H家族65个成员中7个为稳定亲水蛋白、58个不稳定亲水蛋白,蛋白长度差异显著(197~1 451 aa),仅FtC3H43和FtC3H50定位于叶绿体/内质网,其余位于细胞核.(2)保守基序分析发现,Motif1和Motif3普遍存在C3H蛋白中;系统进化分析结果显示,196条C3H蛋白被聚类为5个不同的分支,分别标记为Ⅰ-Ⅴ,太白贝母C3H成员与拟南芥和水稻表现出较近的亲缘关系.(3)GA3处理下,FtC3H22和FtC3H35在A-C时期促进萌发,FtC3H40在A期、FtC3H46在E期响应调控;ABA处理时FtC3H46显著上调,而FtC3H22和FtC3H35下调,推测FtC3H46参与ABA介导的抗寒途径,FtC3H22和FtC3H35则正向调控萌发.该研究揭示了 C3H蛋白家族在太白贝母种子萌发过程中的重要作用和复杂调控机制.
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