水稻POD基因家族鉴定及其结构和功能分析
Identification of POD gene family and analysis of its structure and function in rice
摘要为鉴定水稻POD基因家族成员,分析其结构和功能等特性,该研究利用生物信息学分析方法对水稻POD基因家族成员理化性质、进化关系、染色体定位、启动子顺式作用元件和表达模式进行了系统分析.结果表明:(1)在水稻中共鉴定到64个POD基因,划分为10组,它们不均匀地分布在水稻11条染色体上.(2)保守基序和结构域分析显示,50%以上的成员含有Motif 1、Motif 2、Motif 3、Motif 5、Motif 9、Motif 10和Motif 14,它们排列顺序相似;20个成员具有PL-6 superfamily结构域,14个成员具有HAD_like superfamily结构域.(3)POD基因家族预测到57种调控元件,可分为光响应型、激素响应型、胁迫响应型和生长发育响应型,其中光响应型G-box和激素响应型ABRE调控元件最多.(4)组织表达模式分析显示,Os03t0170900-01、Os03t0170900-02、Os06t0106800-01、Os12t0641400-01 和 Os12t0641400-02 的表达量整体表现最高,推测它们在水稻器官组织形态建成、物质转移、光合作用和抵御胁迫等方面可能发挥着重要作用.该研究结果为深入解析水稻POD基因功能以及抗性分子设计育种提供了重要靶点资源与初步的理论基础.
更多相关知识
- 浏览0
- 被引0
- 下载0

相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文


换一批



