换一批油气田土壤DNA提取方法及油气指示菌基因定量结果的比较
Comparison of DNA extraction methods of oil and gas fields of total soil microorganism with oil and gas indicating gene quantitative methods
摘要采用4种提取方法对油田上方6个土壤样品微生物总基因组DNA进行提取,并比较了其纯度和浓度.利用定量PCR技术定量分析各土壤中甲烷单加氧酶基因(pmoA)和丁烷单加氧酶基因(bmoX).与DNA试剂盒法相比,玻璃珠击打法、液氮研磨法、反复冻融法得到DNA纯度较低,需纯化才能进行后续的PCR扩增.液氮研磨法得到的DNA完整性、纯度和得率较其他提取方法均较好,尤其对于生物量较少的深层油田土壤DNA提取较为实用,成本较低.甲烷单加氧酶基因(pmoA)和丁烷单加氧酶基因(bmoX)的定量PCR结果表明,液氮研磨法提取DNA样品的定量结果在气区和油区均出现一定的高值.液氮研磨法较其他方法更适合于油田土壤DNA的提取.下一步研究可以把丁烷氧化菌作为油气指示菌研究中的重点检测对象.
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关键词
DNA提取土壤微生物甲烷单加氧酶基因丁烷单加氧酶基因DNA extractionsoil microorganismmethane monooxygenase gene (pmoA gene)butane monooxygenase gene (bmoX gene)
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DOI
10.3969/j.issn.1001-6678.2014.02.011
发布时间
2014-06-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
中央高校基本科研业务费专项（JUSRP31105）
中央高校基本科研业务费专项（JUSRP111A10）
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