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苜蓿中华根瘤菌代谢组学样品制备方法的研究

Research of metabolome sample preparation method of Sinorhizobium meliloti

摘要代谢组样品制备是代谢组学研究的基础.本文以维生素B12生产菌株苜蓿中华根瘤菌Sinorhizobium meliloti 320为研究对象,通过检测细胞损伤、ATP泄漏、代谢物回收效率以及细胞代谢淬灭效率综合评价细胞淬灭方法,同时对5种提取试剂的提取效率进行比较优化胞内代谢物的提取方法.最终获得苜蓿中华根瘤菌S.meliloti 320的胞内代谢组学样品制备较佳条件:即-20℃40%甲醇淬灭细胞,过滤收集淬灭细胞,甲醇/乙腈/水(体积比为2∶2∶2,外加0.1%的甲酸)与50%甲醇相结合提取胞内代谢物.实验结果显示-20℃的40%甲醇(通过过滤收集细胞)对细胞膜的损伤较小,且细胞代谢淬灭效率和回收效率较高;甲醇/乙腈/水(体积比为2∶2∶2,外加0.1%的甲酸)与50%的甲醇对胞内代谢物的提取效率较高且有互补作用.

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作者 张田 [1] 张志丹 [2] 刘蛟 [3] 董会娜 [2] 付绍平 [2] 张大伟 [1] 学术成果认领
作者单位 天津科技大学生物工程学院,天津300457;中国科学院天津工业生物技术研究所,天津300308 [1] 中国科学院天津工业生物技术研究所,天津,300308 [2] 天津科技大学生物工程学院,天津,300457 [3]
栏目名称 研究与应用
DOI 10.3969/j.issn.1001-6678.2019.04.001
发布时间 2019-10-24
基金项目
国家重点研发计划 国家自然科学基金
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