换一批
换一批装饰短蚋线粒体全基因组序列测定与分析
Sequencing and analysis of the complete mitochondrial genome sequence of Simulium Ornatum
摘要目的 测定和注释装饰短蚋(Simulium ornatum)线粒体全基因组序列,并在线粒体基因组水平上分析短蚋亚属与蚋亚属、纺蚋亚属之间的系统发育关系.方法 采用长PCR扩增加引物步移法和总DNA测序法对装饰短蚋线粒体全基因组序列进行扩增测序,应用邻接法重建装饰短蚋与其近缘物种的系统发育关系.结果 装饰短蚋线粒体基因组序列全长为 15640 bp,包括 13 个蛋白质编码基因(PCGs)、2 个rRNA基因、22 个tRNA基因及 1 个控制区(CR),A、T、C、G碱基含量分别为38.1%、36.4%、14.7%、10.8%;基于 13 个PCGs序列构建的系统发育关系表示为{[(S.ornatum+S.variegatum)+S.maculatum]+S.aureohirtum}+S.quinquestria-tum,基于DNA条码序列构建系统发育关系表示为{[(S.ornatum+S.variegatum)+S.quinquestriatum]+S.maculatum}+S.aureohirtum.结论 短蚋亚属与蚋亚属杂色蚋组(variegatum group)的亲缘关系最近,利用线粒体全基因组进行系统发育分析DNA条码序列具有更高的分辨率.
更多相关知识
关键词
装饰短蚋线粒体基因组密码子蛋白质编码基因系统发育关系DNA条码控制区Simulium ornatummitochondrial genomecodonprotein-coding genephylogenetic relationshipDNA barcodingcontrol region
分类号
R384
栏目名称
基础研究
DOI
10.19367/j.cnki.2096-8388.2023.08.002
发布时间
2023-09-19
基金项目
国家自然科学基金
- 浏览1
- 被引0
- 下载3
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
