换一批
换一批通过生物信息学方法筛选新的肝细胞癌复发关键蛋白
Detection of recurrent markers for hepatocellular carcinoma based on proteomic data
摘要目的 寻找肝癌复发新的标志物.方法 本研究的蛋白质组学数据来自临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium,CPTAC)数据库.将下载的数据根据肝癌是否复发进行分组,分析两组之间的差异蛋白.生存分析、Cox回归和ROC曲线被用来筛选更具临床意义的差异蛋白.在人类蛋白图谱数据库中对关键的蛋白进行了验证.结果 在50例复发和77例未复发的乙型肝炎相关肝癌患者中,获得了 690个差异表达蛋白.其中,39个蛋白与肝癌的生存分析相关,18个蛋白是肝癌预后的独立影响因素,7种蛋白(BAHCC1、ESF1、RAP1GAP、RUFY1、SCAMP3、STK3和TMEM230)对肝癌5年生存预测的ROC曲线下面积＞0.7.结论 本研究发现了预测肝癌复发的新蛋白,这些关键蛋白是肝癌预后的独立影响因子.
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栏目名称
肝癌
DOI
10.3969/j.issn.1008-1704.2022.11.007
发布时间
2023-01-09
基金项目
佑安肝病感染病专科医疗联盟专项基金
西安医学院校级课题
陕西省教育科学十三五规划课题
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