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东北马鹿微卫星遗传标记的筛选及群体遗传学调查

摘要目的:开发有效的东北马鹿(Cervus elaphus xanthopygus)微卫星DNA遗传标记用于鹿药材的分子生物学鉴别和种质资源鉴定.方法:利用MISA对欧洲马鹿和中亚马鹿基因组进行生物信息学分析获得微卫星DNA遗传标记,并随机挑选10个微卫星遗传标记,对随机抽取的48头东北马鹿进行PCR-STR扩增、电泳分离和分型,选择可成功扩增的部分基因座的等位基因进行测序和群体遗传学参数调查.结果:筛选出CM13S76和CM31S78基因座具有高度多态性.群体遗传学参数显示:CM13S76和CM31S78基因座分别有8和6个等位基因、36和21种基因型,等位基因频率分布范围为0.083 3~0.229 1和0.062 5~0.333 3,个体识别概率(DP)为0.958 4和0.913 4,多态性信息量(PIC)为0.828 1和0.736 8.结论:通过种间生物信息学分析,可弥补东北马鹿微卫星序列信息缺失不足;CM13S76和CM31S78具有高度多态性,有助于鹿药材生物鉴别和种质资源鉴定.

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