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降糖甲治疗2型糖尿病的机制研究

Mechanism of Jiangtangjia granules in the treatment of diabetes mellitus type 2

摘要基于生物信息学、网络药理学和分子对接技术探讨降糖甲颗粒(JTJ)治疗2型糖尿病(T2DM)的作用机制.通过TCMSP、Uniprot数据库、swisstarget和SEA数据库筛选降糖甲颗粒的活性化合物和作用靶点,从GEO数据库获取T2DM患者组胰岛样本和非T2DM患者组胰岛样本数据,利用R语言limma包筛选差异表达基因,二者取交集得到JTJ-T2DM共有靶点.通过Cytoscape3.9.1绘制JTJ-T2DM-靶点网络图,利用STRING数据库、Cytoscape3.9.1的cytoHubb插件制作JTJ-T2DM共有靶点的PPI网络图并获取关键靶点(Hubs).利用DAVID平台对JTJ-T2DM共有靶点进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析,对共有靶点有差异表达并进行ROC分析,最后通过DS BIOVIA软件进行分子对接验证.结果显示,最终获得41个JTJ活性化合物,909个药物作用靶点,2952个T2DM靶点,JTJ-T2DM交集靶点160个,Hubs 12个;GO及KEGG富集分析结果显示,JTJ主要参与细胞凋亡等过程,调控MAPK及AGE-RAGE等信号通路而治疗T2DM;差异表达结果显示,MAPK14、PRKCZ、PTPN11具有显著差异表达且诊断价值高;分子对接结果显示(+)-丁香树脂醇-O-β-D-葡萄糖苷与LCK和PTPN11亲和力最强,蒙花苷与PRKCZ亲和力最强.本研究初步揭示了降糖甲颗粒治疗2型糖尿病的作用机制,为其治疗2型糖尿病提供充分、可靠的理论依据.

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分类号 R284.1
栏目名称 生命科学
DOI 10.3969/j.issn.1003-6563.2024.01.006
发布时间 2024-03-19
基金项目
贵州省卫生健康委科学技术基金项目
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贵州科学

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