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青天葵DXR基因编码蛋白的生物信息学分析

Bioinformatics Analysis of Gene DXR from Nervilia fordii

摘要为后期青天葵DXR基因的全长克隆、功能鉴定和调控研究奠定基础,采用生物信息学方法对前期通过转录组测序获得的青天葵DXR基因编码蛋白序列进行分析.结果表明:NfDXR序列包含457个氨基酸,分子量约为49.72 Ku,为亲水性、混合结构型蛋白质.NfDXR属于1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶超级家族,含有DXR功能域、2个NAPDH结合基序和2个DXR活性位点基序,不具有跨膜结构域和信号肽结构.NfDXR与其他单子叶植物DXR同源性高,其中与铁皮石斛DXR的序列相似度达90%.

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分类号 S567.23+9
栏目名称 园艺·中药材
DOI 10.3969/j.issn.1001-3601.2016.02.034
发布时间 2016-06-15
基金项目
国家自然科学基金项目“中药青天葵分枝发育相关基因的研究” 广东省自然科学基金博士启动项目“中药青天葵黄酮类生物合成途径关键酶基因CHS和FLS的功能和调控研究”
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