换一批
换一批植物乳杆菌及其近缘种部分看家基因的系统发育分析
Phylogenetic Analysis of Lactobacillus plantarum and Related Species Using Partial Housekeeping Genes
摘要本文研究了16S rRNA基因、pheS和pyrG部分基因序列对Lactobacillus plantarum(L.plantarum)及其近缘种的区分能力,采用分离自酸面团、酸牛奶和泡菜中的10株L.plantarum为研究对象,以其看家基因pheS和pyrG部分基因序列作为分子标记,结合已上传至GeneBank的近缘种的相应序列构建系统发育树并与以16S rRNA基因构建的系统发育树进行比较.结果表明:基于16SrRNA基因序列不能区分L.plantarum及其近缘种,而看家基因pheS和pyrG部分基因序列能够很好的区分植物乳杆菌种及其近缘种,其中,pheS在植物乳杆菌种内分型时相较于pyrG基因效果更好,以及将pheS和pyrG部分基因序列串联使用后,试验菌株与参考菌株的分类关系更加明晰,因此,联合基因(pheS-pyrG)可作为16S rRNA基因的辅助工具用于L.plantarum及近缘种和植物乳杆菌种内分型的快速分类鉴定.
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栏目名称
基础研究
DOI
10.13982/j.mfst.1673-9078.2017.1.016
发布时间
2017-03-28
基金项目
国家科技重大专项
中国农业研究体系
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