换一批随机扩增多态性DNA分子标记技术在肠球菌分型中的应用
Application of Random Amplified Polymorphic DNA Molecular Marker Technique in Typing of Enterococcus
摘要该研究旨在探索随机扩增多态性DNA(Random Amplified Polymorphic DNA,RAPD)分子标记技术在肠球菌种间快速分型的效果.试验通过筛选模板、单引物、双引物及RAPD反应体系,构建肠球菌种间分型体系,对32株已知肠球菌分型确定分型相似度标准,并通过对46株未知肠球菌进行种间分型以及管家基因rpoA测定验证分型效果.结果显示微波法提取基因组DNA满足实验需要,筛选出7条单引物用于双引物配对组合,最适的双引物反应体系为:2×PCR Taq Mix 12.5 μL,模板DNA 1 μL,引物各1 μL,ddH2O 9.5 μL;分型效果最好的双引物组合为 Primer1+Primer5,该引物组合可以在 80%的相似度下区分肠球菌种间差异,Primer1+Primer3组合在500 bp位置扩增出海氏肠球菌的特征条带,可以作为海氏肠球菌的鉴定指标,用以快速鉴定海氏肠球菌.
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关键词
肠球菌随机扩增多态性DNA双引物体系优化Enterococcusrandom amplified polymorphic DNApairs of primersystem optimization
栏目名称
DOI
10.13982/j.mfst.1673-9078.2023.11.1513
发布时间
2023-12-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
四川省自然科学基金面上项目（2022NSFSC0114）
西南民族大学研究生创新型科研项目（CX2021SZ14）
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