噬菌体分类学技术进展

Advances in Bacteriophage Taxonomy Techniques

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摘要噬菌体是一类细菌病毒,能特异性识别并杀灭细菌,具有替代抗生素的潜力,特别是在食品安全领域中,以解决"人-环-食"生态链中泛耐药病原微生物的威胁.噬菌体分类学是阐明噬菌体间物种进化和发展规律的重要学科.近年来,随着新一代测序、培养组学等技术发展,噬菌体分类出现了许多新的技术进展与挑战.该文通过回顾噬菌体分类学的发展历程,阐明目前常用分类技术的优缺点;同时,该文系统总结了噬菌体进化分类的具体方案,重点探讨了分类学标尺及系统发育构建的前沿进展;最后,该文归纳了目前噬菌体分类技术的新进展,重点推荐了纯培养噬菌体分类的可靠流程,并讨论了培养组学、宏病毒组及原噬菌体分析手段对噬菌体分类学技术的挑战与要求.该文为噬菌体分类学技术的进一步发展提供参考.

作者黄士轩 ^[1] 朱斌 ^[1] 何嘉欣 ^[1] 李滢 ^[2] 薛亮 ^[2] 周星佑 ^[3] 伍君权 ^[3] 陈谋通 ^[1] 张菊梅 ^[1] 吴清平 ^[2] 杨美艳 ^[1] 学术成果认领

作者单位华南农业大学农学院&食品学院,广东省食品质量安全重点实验室,广东广州 510642;广东省科学院微生物研究所,华南应用微生物国家重点实验室,广东省微生物安全与健康重点实验室,国家卫健委微生物食品营养与安全科技创新平台,广东广州 510070 ^[1] 广东省科学院微生物研究所,华南应用微生物国家重点实验室,广东省微生物安全与健康重点实验室,国家卫健委微生物食品营养与安全科技创新平台,广东广州 510070 ^[2] 华南农业大学农学院&食品学院,广东省食品质量安全重点实验室,广东广州 510642 ^[3]

关键词噬菌体分类学进化分类法系统发育宏病毒组 bacteriophage taxonomy molecular evolutionary classification phylogenetic meta-virome

栏目名称

专题综述

DOI 10.13982/j.mfst.1673-9078.2024.9.1146

发布时间 2024-10-29

基金项目

国家自然科学基金（32202194）；国家重点研发计划（2022YFF1100700）；广州市重点研发计划项目（SL2022B03J01243）；广东省重点研发计划项目（2022B1111040002）；广东省科学院项目（2022GDASZH-2022020402-01）