换一批利用高通量测序挖掘柠檬醛型野草香中的香叶醇脱氢酶基因
Mining the Geraniol Dehydrogenase Gene in a Citral Chemotype of Elsholtzia cyprianii via High-throughput Transcriptome Sequencing
摘要以药食两用植物柠檬醛型野草香为原料进行精油提取及GC-MS成分测定,并利用Illumina NovaSeq 6000高通量测序获得其转录组数据信息,挖掘其精油合成关键酶基因.结果表明,该野草香种质柠檬醛含量在80％以上,高通量测序后共获得22.08 GB数据,147 186 998条高质量序列,利用Trinity组装获得33 720条unigenes,平均长度1 799 bp,均在7大公共数据库中成功获得功能注释.通过KEGG代谢通路分析显示有2条单萜代谢相关途径,为萜类骨架生物合成(编号为ko00900)和单萜类生合成(编号为ko00902),相关unigenes分别有109条和32条;扩增获得1 143 bp的香叶醇脱氢酶基因(GeDH),编码380个氨基酸,具有保守的Zn2、NADP结合位点和类似于紫苏属植物的Zn1结构基团,为进一步研究香薷属植物特色精油中单萜生物合成途径解析寻找到新的切入点.GeDH基因作为调控柠檬醛精油合成的关键酶,其挖掘为天然柠檬醛精油的开发利用提供了一定的帮助,为拓宽食用调味油、天然食品抗菌剂的种类奠定了基础.
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关键词
高通量测序野草香柠檬醛精油香叶醇脱氢酶high-throughput sequencingElsholtzia cyprianii(Pavolini)S.Chow ex P.S.Hsucitralessential oilsgeraniol dehydrogenase
栏目名称
DOI
10.13982/j.mfst.1673-9078.2024.12.1390
发布时间
2025-02-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（32260102）
云南省院士专家工作站项目（202305AF150030）
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