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基于单细胞核测序的肝癌细胞组成及其演化路径研究

Research on the composition and evolutionary pathways of liver cancer cells based on single-cell nuclear sequencing

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摘要目的:基于单细胞核测序探讨肝癌的细胞组成并揭示其演化过程.方法:收集2020年5月至2022年3月深圳市龙岗区人民医院5例肝癌患者术后切除样本,包括癌与癌旁组织,通过单细胞核测序分离鉴定细胞组成,采用特异性的细胞标志物细分细胞类型,并选取特定基因和信号通路预测其演化过程.结果:通过5例肝癌样本的单细胞核测序分析发现,肝癌细胞组分主要包括肝实质细胞(68.35%)、胆管细胞(6.3%)、内皮细胞(6.55%)、肝星状细胞(3.9%)、髓系细胞(6.8%)、T/NK/B细胞(7.6%)以及其他未定义细胞(0.5%).髓系细胞中的巨噬细胞高表达分泌型磷蛋白1(SPP1)和糖蛋白nmb(GPNMB).肝星状细胞存在部分表达肝细胞生长因子(HGF)基因的细胞,且存在高表达成纤维细胞活化蛋白(FAP)的癌相关成纤维细胞.内皮细胞高表达细胞周期调节因子(RGCC)基因.混合癌中存在胆碱激酶表达下调而上皮细胞黏附分子(EPCAM)的表达上调的胆管癌细胞.KEGG信号通路分析发现差异表达基因(DEGs)主要参与代谢相关通路.结论:单细胞核RNA测序揭示肝癌由7种细胞构成,在不同的肝癌类型中比例略有差异,每种细胞具有促进肿瘤发展的相关基因表征,信号通路分析发现肝癌与代谢通路密切相关.

作者 林锦波 ^[1] 张云凤 ^[2] 蔡松涛 ^[3] 陈涛 ^[4] 阳书坤 ^[5] 赵博晨 ^[6] 付佳蕊 ^[7] 学术成果认领

作者单位 香港中文大学(深圳)附属第二医院深圳市龙岗区人民医院翰邻城社康,广东深圳 518172;遵义医科大学珠海校区,广东珠海 519041 ^[1] 深圳市龙岗区人民医院科教科,广东深圳 518172 ^[2] 香港中文大学(深圳)附属第二医院深圳市龙岗区人民医院翰邻城社康,广东深圳 518172 ^[3] 广州医科大学呼吸疾病国家重点实验室,广东广州 510180 ^[4] 深圳市龙岗区人民医院医务部,广东深圳 518172 ^[5] 深圳市龙岗区人民医院普外科,广东深圳 518172 ^[6] 遵义医科大学珠海校区,广东珠海 519041 ^[7]

关键词单细胞核RNA测序癌,肝细胞细胞组成代谢通路演化 single-cell nuclear RNA sequencing carcinoma,hepatocellular cell composition metabolic pathway evolution

分类号 R735.7（消化系肿瘤）

栏目名称

论著

DOI 10.3969/j.issn.2095-9664.2025.02.02

发布时间 2025-06-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

基金项目

深圳市龙岗区医疗卫生科技计划项目（LGKCYLWS2021000010）