换一批
换一批基于铁死亡相关的lncRNA在肺鳞癌预后的分析
Prognostic analysis based on ferroptosis related lncRNAs in lung squamous cell carcinoma
摘要目的 探究铁死亡相关的lncRNA在肺鳞状上皮细胞癌(简称肺鳞癌)患者中的预后意义.方法 从美国癌症和肿瘤基因图谱数据库(the Cancer Genome Atlas,TCGA)中下载肺鳞癌数据551例,包括49例正常对照样本和502例肺鳞癌患者样本.筛选出与铁死亡相关基因的共表达的lncRNA,使用单变量Cox回归进一步筛选lncRNA,然后,使用Lasso回归和多元Cox回归分构建铁死亡相关的lncRNA模型.建立基于模型的风险评分,并使用Cox回归测试其是否为独立的预后因素.铁死亡相关lncRNAs的功能富集使用基因本体(Gene Ontology)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)可视化.结果 4个预后铁死亡相关的lncRNA(AC253536.6,FLJ46906LUCAT,AC022150.2)显著不同,这构建了铁死亡相关的lncRNA模型.此模型将肺鳞癌患者分为低风险组和高风险组.基于模型的风险评分是肺鳞癌患者的显著独立因素(HR=2.116,95％CI=1.513～2.961;P<0.001).此外,4个lncRNA在铁死亡过程,代谢和肿瘤经典途径中均显著富集.结论 4个铁死亡相关的lncRNAs可能是肺鳞癌患者的分子生物标志物和治疗靶标.
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