基于网络药理学及分子对接探究解肌透疹方干预基孔肯雅热的作用机制
Exploring the Mechanism of Jieji Touzhen Formula Against Chikungunya Fever Based on Network Pharmacology and Molecular Docking
摘要[目的]运用网络药理学与分子对接技术,探讨解肌透疹方干预基孔肯雅热的作用机制.[方法]通过TCMSP数据库获取解肌透疹方活性成分及其对应的作用靶标;从GeneCards、OMIM、GEO数据库收集基孔肯雅热疾病相关靶点;筛选解肌透疹方与基孔肯雅热的交集靶点;借助网络可视化与数据分析工具Cytoscape构建"药物-成分-靶点"网络;通过蛋白质-蛋白质互作(PPI)分析、基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析揭示解肌透疹方治疗基孔肯雅热的潜在机制;采用分子对接及分子动力学模拟验证解肌透疹方关键活性成分与基孔肯雅病毒(CHIKV)细胞受体基质重塑相关蛋白8(MXRA8)的结合.[结果]共筛选出解肌透疹方99个活性成分.获得解肌透疹方活性成分靶点与基孔肯雅热相关基因的交集靶点78个,核心靶点包括AKT1、PTEN、HIF1A、MAPK3、PTGS2、MMP9等.KEGG富集分析显示30条显著信号通路(P<0.05)可能与解肌透疹方治疗基孔肯雅热有关,包括VEGF信号通路、TNF信号通路、FoxO信号通路、HIF-1信号通路等.分子对接表明,紫花前胡苷、荷包牡丹碱、芍药苷、辛夷脂素、木犀草素、槲皮素、芍药甙元酮、连翘苷、香豆醇、藿香黃酮醇、连翘脂素、刺芒柄花素、芒柄花酮II、楝叶吴萸素B等与MXRA8蛋白均具有较强的结合活性.分子动力学模拟进一步证明解肌透疹方中紫花前胡苷与MXRA8蛋白可以稳定结合.[结论]解肌透疹方可能通过紫花前胡苷、荷包牡丹碱、芍药苷、辛夷脂素、木犀草素等关键活性成分,作用于AKT1、PTEN、HIF1A、MAPK3、PTGS2、MMP9等核心靶点,调节VEGF信号通路、TNF信号通路、FoxO信号通路、HIF-1信号通路等,发挥抗炎、恢复抗病毒免疫、改善免疫应答等作用.分子对接和分子动力学模拟表明紫花前胡苷与MXRA8蛋白结合作用最强,可能通过靶向MXRA8蛋白、抑制病毒入侵,进而发挥抗病毒作用.
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