石斛碱通过作用于SRC调控氧化应激干预糖尿病肾病的机制研究
The mechanism of dendrobine intervenes in diabetic kidney disease by acting on SRC to regulate oxidative stress
摘要目的:探讨石斛碱通过调控氧化应激干预糖尿病肾病(DKD)的作用机制.方法:利用OMIM等数据库检索DKD靶点,使用PharmMapper、SuperPred、ChemMapper和ChEMBL数据库获得石斛碱靶点,通过GeneCards、OMIM数据库检筛选氧化应激相关靶点,并取交集靶点.交集靶点导入STRING数据库获取靶标相互联系以构建PPI,利用MCC拓扑算法分析获取关键靶点.关键作用靶点通过DAVID平台进行基因本体论(GO)分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.通过SangerBox平台进行糖尿病肾病临床相关性分析、基因差异表达分析以及ROC分析.将筛选得到的关键靶点通过分子对接和分子动力学模拟进行验证.采用Western Blot实验进行实验验证.结果:获得DKD-石斛碱-氧化应激交集靶点102个,并筛选出 15个关键基因;通过临床相关性分析筛选出 11个有临床意义的关键基因;通过差异表达和ROC分析发现CASP3、CXCR4、ESR1、KDR、SRC差异表达明显,且SRC最具有诊断价值(AUC=0.86,P<0.05);分子对接及分子动力学模拟分析结果发现SRC与石斛碱结合能力最强,且配合物较稳定.Western Blot实验结果表明,与对照组相比SRC和P-SRC在DKD中表达上调(P<0.05),石斛碱可降低其的表达.结论:石斛碱可以通过作用于SRC调控氧化应激干预糖尿病肾病.
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