浒苔(Ulva prolifera)核糖体基因簇单元全长序列的克隆与分析

Cloning and Analysis of Full Length Sequence of Ulva prolifera Ribosomal Gene Cluster Unit

二维码有效期 120s

摘要核糖体基因簇单元全长序列对于藻类分子鉴定与分类具有重要意义,而浒苔(Ulva prolifera)作为形成我国黄海绿潮的主要物种,其核糖体基因簇单元全长序列的克隆还未见研究报道.本研究通过分子克隆技术成功扩增了浒苔的核糖体基因簇单元全长序列.浒苔核糖体基因簇单元全长序列为8 948 bp,其中18S rDNA 1 760 bp,28S rDNA 3 259 bp,ITS1 205 bp,5.8S rDNA 160 bp,ITS2 176 bp和IGS 3 388 bp.对各部分序列的碱基组成进行分析后,我们发现ITS1,ITS2和IGS序列对胞嘧啶具有明显的偏好性,而18S rDNA和28S rDNA序列对鸟嘌呤具有明显的偏好性.浒苔核糖体基因簇单元全长序列的GC含量为54.12％,其中ITS1、ITS2和IGS序列的GC含量比保守序列的GC含量高,这表明内转录单元间隔区序列和基因间间隔区序列比保守序列变异率更高,进化速率更快.另外,IGS序列中发现大量简单的直接重复序列、串联重复序列、短对称序列和回文序列.浒苔核糖体基因簇单元全长序列可为其分类及分子鉴定提供有效的工具.