两种二倍体野生花生ABI3/VP1的全基因组鉴定与分析

Genome Identification and Analysis of ABI3/VP1 in Two Diploid Wild Peanuts

二维码有效期 120s

摘要ABI3/VP1 在植物生长发育过程中起重要调节作用.该研究以模式生物拟南芥为参考,在 2 个二倍体野生花生的全基因组序列中鉴定了 ABI3/VP1 基因家族成员,并用一系列生物信息学方法对其进行了系统发育、理化性质、二级结构预测、染色体定位及启动子顺式作用元件分析.研究成功从花生基因组中鉴定出 17 个 ABI3/VP1 基因,这些基因不均匀地分布在 11 条染色体上.与拟南芥相比,花生的 ABI3/VP1 基因数量较多,可能由于两者祖先物种分歧时的基因丢失或加倍.系统发育分析表明,花生古老支中的许多基因与拟南芥有较近的亲缘关系.观察两个不同的花生种在三个亚家族中的分布,发现Adu和Aip 两种在古老支中的基因数量相同,但在中间支和现代支中,Aip 的基因数量明显小于Adu.这可能是由于地理差异或种间相关基因的差异.值得注意的是,Aip 的相关基因从中间支到现代支经历了数量变化,推测这与基因的丢失或古老基因的加倍与进化有关.花生 ABI3/VP1 基因被推测参与多个信号通路,调控花生的生长发育过程和对环境刺激的响应.研究结果为后续开展花生ABI3/VP1 基因调控脱落酸信号转导相关的研究提供了科学依据,对花生生长发育与果实成熟具有重要意义.