换一批基于网络药理学和蛋白模块分析桂枝汤防治冻伤作用机制
Exploring the mechanism of Guizhi Tang in preventing and treating frostbite based on network pharma-cology and protein module analysis
摘要目的 基于网络药理学和蛋白模块分析理论探究桂枝汤防治冻伤的关键靶点及关键模块,并阐述其作用机制.方法 利用TCMSP数据库筛选出满足条件(O B≥30％和DL≥0.18)的桂枝汤中药材活性化合物,通过BATMAN数据库预测所得活性成分的靶点.通过CTD、GeneCards、OMIM三大疾病数据库查找冻伤相关基因,并利用UniProt数据库对靶点进行标准化.通过St ring数据库对桂枝汤与冻伤的共有靶点进行GO和KEGG通路富集分析.借助Cytoscape3.7.0软件对桂枝汤"药材-活性化合物-靶点-通路"进行加权网络构建,获取关键靶点.再运用层次聚类凝聚算法对蛋白相互作用网络进行模块化分析,结合关键靶点筛选关键模块,并对各个模块进行富集分析.结果 在五味中药里共筛选出146种符合要求的化合物,预测得到602个桂枝汤成分的药物靶点、744个冻伤的疾病靶点,取交集后得到45个靶点.构建"活性化合物-靶点-通路"加权网络筛选出关键靶点15个,主要包括TNF、PTGS2、IL1B等,得到关键蛋白模块一、二、三和四.其中,聚类模块一主要与肿瘤坏死因子信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化、花生四烯酸的新陈代谢有关,此类通路均作用于血管内皮细胞;聚类模块二主要与炎症反应的调节和凝血系统的调节有关;聚类模块三主要与氧化代谢反应及产热有关;聚类模块四主要与外界因子的刺激调节有关.结论 桂枝汤可以通过干预皮肤血管内皮细胞、炎症反应、凝血与血栓的形成、氧化代谢反应及产热等相关的生物过程发挥防治冻伤的作用.
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关键词
桂枝汤冻伤网络药理学蛋白模块分析层次聚类凝聚算法Guizhi TangFrostbiteNetwork pharmacologyProtein module analysisHierarchi-cal clustering and agglomerative algorithm
分类号
R96（药理学）
栏目名称
DOI
10.19539/j.cnki.2095-2694.2024.04.001
发布时间
2024-08-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
河北省自然科学基金资助项目（H2023209005）
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