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甘肃河西地区西门塔尔杂交类群NGB基因第4外显子的遗传变异研究

Genetic Variation Study of NGB Gene Exon 4 of Simmental Cattle Hybrid Taxon in Gansu Hexi Regions

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摘要为研究甘肃河西的临泽、甘州、凉州、金昌、高台5个地区西门塔尔杂交类群NGB基因第4外显子的遗传多态性及其变异特征，采用PCR-SSCP方法检测了283头西门塔尔杂交类群NGB基因第4外显子和部分内含子的多态性，并对群体内各等位基因进行了测序。结果显示：5个地区西门塔尔杂交类群共检测出5个等位基因（ A、B、C、D、E），表现为6种基因型（ AA、BB、AB、AC、AD、AE）。5个地区西门塔尔杂交类群均能检测到 AA、BB、AB 3种基因型，且甘州、凉州、高台西门塔尔杂交类群还分别检测到 AC、AD、AE 3种基因型。A 等位基因频率在5个群体中最高，为优势等位基因。对不同SSCP带型的对应片段进行测序分析，共发现5个核苷酸突变位点（31 bp C→T、68 bp G→C和G→A、129 bp A→G、207 bp C→T），5处突变中仅第207 bp处单核苷酸突变落在外显子区域，其余均落在内含子区域，但均未导致氨基酸发生改变。χ2检验结果显示，5个地区西门塔尔杂交类群在第207 bp处单核苷酸突变位点上仅凉州、金昌西门塔尔杂交类群处于Hardy-Weinberg平衡状态（P>0.05）。群体遗传学分析结果表明，临泽、甘州、凉州、金昌、高台西门塔尔杂交类群的多态信息含量（ PIC）分别为0.3582，0.3839，0.4279，0.3682，0.3947，均属于中度多态（0.25<PIC<0.5）。