换一批水稻多胚候选基因OsPE可变剪接体鉴定与分析
Identify and Analyze the Splice Variants of Polyembryo Candidate Gene OsPE in Rice
摘要为进一步探究水稻多胚候选基因OsPE的生物学功能,以粳稻品种日本晴和籼稻品种巴斯马蒂370 为研究材料,选取正常生长条件下供试材料的成熟叶片,综合运用生物信息学、RT-PCR、TA克隆、半定量及qPCR等技术鉴定并分析水稻多胚候选基因OsPE的可变剪接体.结果表明,虽然生物信息学分析显示OsPE基因在粳稻中存在3 种可变剪接体,在籼稻中无可变剪接体,但通过特异引物进行RT-PCR扩增,结合TA克隆及测序验证,在粳稻品种日本晴中鉴定到了OsPE基因3 种可变剪接体的真实存在;在籼稻品种巴斯马蒂 370 中鉴定到 2 种新的可变剪接体.同时,半定量及qPCR结果显示:正常生长条件下,供试材料成熟叶片中OsPE基因可变剪接体存在表达差异,依次为OsPEc＞OsPEa＞OsPEb,且该基因在不同水稻品种中存在相同的表达趋势.最后,水稻OsPE基因编码蛋白进化分析及功能预测分析结果显示:OsPE蛋白在禾本科,尤其是稻属中高度保守(蛋白序列一致性普遍高于 99%),有待于进一步研究该基因是否参与调控水稻抗逆响应、细胞分裂及细胞凋亡等生物学功能,而不是调控水稻多胚产生.综上所述,OsPE基因在禾本科,尤其是稻属中高度保守,该基因在粳稻和籼稻中可能有着相同的剪接模式,其可变剪接体在正常生长条件下存在表达差异,但表达趋势相同,OsPEc剪接体在OsPE基因功能发挥中占主导,有待于进一步研究该基因是否参与调控水稻抗逆响应、细胞分裂及细胞凋亡等生物学功能,而不是调控水稻多胚产生.
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DOI
10.7668/hbnxb.20193664
发布时间
2023-07-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
湿地生态与农业利用教育部工程研究中心开放基金团队项目（KFT202002）
农业农村部农作物精准鉴定项目（125A0605）
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