换一批摘要蛋白质编码区预测中阈值选择对预测结果的影响不容忽视.研究提出以归一化的功率谱密度作为判别DNA序列编码区和非编码区的阈值,以FIR (Finite impulse response,FIR)窄通带滤波器NPBF(Narrow pass band filter,NPBF)作为编码区预测算法核心,采用DNA序列集HMR195和ALLSEQ作为测试集,以碱基层的近似相关系数(Approximate correlation,AC)为预测准确率测度指标,对所提出方法与现有方法的预测结果做了比较.结果表明,采用新阈值得到的预测准确率最高,算法简单直观.
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关键词
蛋白质编码区预测窄通带滤波器归一化的功率谱密度值信噪比近似相关系数protein coding regions predictionnarrow pass-band filternormalized value of power spectrum densityratio of signal to noiseapproximate correlation
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DOI
10.3969/j.issn.0439-8114.2014.06.055
发布时间
2014-06-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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