EBV感染Jurkat T细胞生理生化特性以及转录组分析
Physiological and Biochemical Characteristics and Transcriptome Analysis of EBV Infected Jurkat T Cells
摘要目的:通过对EBV刺激过表达CD21 的Jurkat T细胞进行转录组测序分析,研究EBV感染T细胞的机制.方法:经过PCR技术克隆目的基因CD21,再通过分子克隆技术将 CD21 基因插入到过表达慢病毒载体上,使其在Jurkat T细胞表面稳定表达.通过EBV刺激过表达CD21 的Jurkat T细胞(EBV-LV-Jurkat),然后与未经处理的Jurkat T细胞和仅经过慢病毒感染的 Jurkat T 细胞(LV-Jurkat)均进行普通转录组测序,并对EBV-LV-Jurkat T 与LV-Jurkat T这两组进行差异表达基因的富集通路分析.结果:通过对EBV感染过表达CD21 的Jurkat T细胞(EBV-LV-Jurkat T)与过表达 CD21 的 Jurkat T细胞(LV-Jurkat T)差异表达基因(DEGs)GO 富集分析发现,其中在分子功能方面主要富集于 MAP激酶酪氨酸磷酸酶活性信号通路,其相关基因DUSP1、DUSP10、DUSP5、DUSP8 等被显著富集.对 EBV-LV-Jurkat T与LV-Jurkat T的DEGs进行KEGG 代谢通路分析发现,多种与 EBV 感染 B 细胞之后相似的细胞通路以及分子主要富集于MAPK、IL-17、HIF-1、NF-κB 与 PI3K/AKT 等信号通路,以及免疫反应系统相关基因也被显著富集.结论:成功构建了CD21 过表达的Jurkat T 细胞模型,并通过转录组测序揭示了EBV刺激能够显著上调MAPK信号通路.这为进一步探索EBV感染T细胞的机制提供了重要的初步数据.
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