换一批黄芩转录组SNP和InDel位点的挖掘及特征分析
Identification and characterization of SNP and InDel variants in Scutellaria baicalensis Georgi transcriptom
摘要目的 为开发黄芩特异性分子标记,进行遗传多样性分析和分子标记辅助育种.方法 对黄芩花和根转录组中的单核苷酸多态性标记(single nucleotide polymorphism,SNP)和插入缺失多态性标记(in-sertion and deletion,InDel)进行分析.结果 在18个黄芩花和根转录组中发现平均每个样品含有216 067个SNP位点,转换与颠换比值为1.42～1.61,且分布在外显子区的位点最多,发生错义突变的位点数量最多.InDel位点数平均每个样品包含22 864个,插入型位点数大于缺失型,在基因内分布最多,发生移码插入的位点最多.结论 黄芩花和根转录组中具备丰富的SNP和InDel位点,并且具有较高的多态性.该研究为后续黄芩开展特异性分子标记开发提供数据支持.
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分类号
R2（中国医学）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1674-490X.2025.06.004
发布时间
2026-01-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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