换一批
换一批贲门癌中长链非编码RNA和微小RNA差异表达谱及相关性分析
Differential expression profiles and correlation analysis of lncRNA and miRNA in gastric cardia adenocarcinoma
摘要目的:分析贲门癌与癌旁组织中长链非编码RNA (lncRNA)和微小RNA(miRNA)的差异表达谱及二者的相关性.方法:利用基因芯片技术鉴定15例贲门癌与癌旁组织中的lncRNA及miRNA的差异表达谱,生物信息方法分析与H19相互作用的候选miRNA分子,qRT-PCR验证H19和miR-148a-3p在贲门癌中表达的相关性.结果:15例贲门癌与癌旁组织中鉴定出5倍以上差异性表达的lncRNA 182个,2倍以上差异性表达的miRNA 152个.生物信息学预测结果表明,lncRNA H19与7个miRNA表达具有相关性.qRT-PCR验证37例贲门癌与癌旁组织中H19和miR-148a-3p的表达呈负相关(r=-0.398,P＜0.001).结论:贲门癌中差异表达的lncRNA和miRNA分子参与了癌变过程,H19可能直接调控miR-148a-3p的表达.
更多相关知识
关键词
贲门癌基因芯片生物信息预测长链非编码RNA微小RNAgastric cardia adenocarcinomamicroarraybioinformatics predictionlncRNAmiRNA
分类号
R735.2
栏目名称
DOI
10.13705/j.issn.1671-6825.2017.03.043
发布时间
2018-05-09
基金项目
国家自然科学基金资助项目（81472234）
- 浏览194
- 被引3
- 下载92
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
