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基于加权基因共表达网络分析探究养肺方治疗非小细胞肺癌的作用机制及实验验证

Action Mechanism of Lung Nourishment Formula inTreatment of Non-small Cell Lung Cancer Based on Weighted Gene Co-expression Network

摘要目的:基于网络药理学联合加权基因共表达网络分析(weighted correlation network analysis,WGCNA)及实验验证初步探究养肺方治疗非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的作用机制.方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选养肺方组方中药的化学成分.利用中医药百科全书(The encyclopedia of traditional Chinese medicine,ETCM)预测养肺方活性成分相关靶点.运用GEO平台下载基因芯片GSE118370,采用GEO2R归一化数据并分析差异基因.采用WGCNA进行基因模块分析并筛选疾病靶点基因.利用Cytoscape 3.7.2 软件构建的"药物-活性成分-靶点"网络并进行拓扑分析筛选有效药效成分.将WGCNA筛选出核心基因与药物靶点取交集得到治疗靶点,并构建蛋白质互作(protein-protein interaction,PPI)网络,通过Cytoscape 3.7.2 中的CytoHubba筛选出核心治疗靶点.利用R软件进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析.40 只雄性Wistar大鼠随机分为养肺方组(400 g·kg-1)和空白组,每组20 只,大鼠连续灌胃给药7 天,每天2 次,灌胃结束后腹主动脉取血制备含药血清.采用不同浓度含药血清干预人肺腺癌PC9 细胞株后,CCK-8 试剂检测细胞活力;Western Blot检测p-蛋白激酶B(protein kinase B,AKT)、p-磷脂酰肌醇 3-激酶(phosphatidylinositol 3-kinases,PI3K)蛋白表达水平;实时定量荧光PCR分析PI3K mRNA、AKT mRNA表达水平;TUNEL检测细胞凋亡水平;结果:在TCMSP 数据库中筛选出65 个养肺方活性成分;通过ETCM数据库获得283 个药物靶点.利用GEO2R分析得到差异基因1192 个.WGCNA基因模块分析得到核心基因30 个,与药物靶点取交集,获得交集靶点基因10 个.PPI网络分析得到核心靶点5 个.富集分析得到939 个GO条目及82 条信号通路.CCK-8 检测发现养肺方含药血清浓度为10%时,细胞活力最差.与空白组比较,养肺方组p-PI3K、p-AKT蛋白表达水平及PI3K、AKT的mRNA表达水平明显降低(P<0.05),TUNEL染色阳性细胞数显著增加(P<0.05).结论:养肺方可能通过抑制PI3K/AKT通路诱导NSCLC肿瘤细胞凋亡,进而改善NSCLC.

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中医学报

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2023年38卷9期

1950-1960页

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