基于全菌消减SELEX技术的体外筛选大肠埃希菌O157∶H7适配体研究
In vitro screening of Escherichia coli O157∶H7-specific ssDNA aptamer by whole-bacterium based subtractive SELEX
摘要目的 筛选出能特异性识别大肠埃希菌O157∶H7的单链DNA(ssDNA)适配体并进行鉴定.方法 利用全菌消减SELEX技术,以完整菌体为靶标菌和消减菌,通过体外筛选方法筛选出大肠埃希菌O157∶H7特异性ssDNA适配体.利用荧光分光光度计、激光共聚焦显微镜、克隆测序、Chromas和DNAMAN分析软件,分析适配体的一、二级结构,并对筛选得到的适配体进行特异性鉴定.结果 经过7轮全菌消减SELEX筛选,荧光分光光度计检测结果鉴定第六轮文库富集达到饱和;通过测序分析、荧光分光光度计和激光共聚焦显微镜特异性检测,获得1条与大肠埃希菌O157∶H7特异性结合的适配体Aptamer1.结论 利用全菌消诚SELEX技术成功筛选获得大肠埃希菌O157∶H7特异性ssDNA适配体.
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