换一批空气污染对小鼠骨髓转录本水平差异表达的影响
Effects of air pollution on differential expression of transcripts in mouse bone marrow
摘要目的 探讨空气污染对小鼠骨髓转录本水平差异表达的影响.方法 使用暴露在空气和PM2.5中的小鼠骨髓细胞的公共RNA-seq数据作为研究对象,分别比较基因和转录本水平的差异表达事件,通过Isoform Switch Analyze R分析转录本表达水平上的差异的同时,也分析转录本结构层面的变化.结果 基因水平上的差异表达事件不多,但从转录本水平入手可以鉴定到更多有效的信号.以Lgr4基因为例,虽然基因表达水平在处理前后没有差异,但两个具有蛋白质编码功能的转录本差别非常明显,即ENSMUST00000111037的使用明显增加,而ENSMUST00000046548的使用明显减少.结论 从转录本水平研究环境污染对生物体的影响可以提供更为深入的理解,有助于寻找检测环境污染和治疗污染诱发疾病的生物靶点.
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分类号
R994.6（毒物学《毒理学》）
栏目名称
DOI
10.16241/j.cnki.1001-5914.2024.10.016
发布时间
2024-11-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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