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基于生物信息学方法分析层黏连蛋白亚基α1基因在多形胶质母细胞瘤中的表达及对预后的影响

Effect of laminin subunit alpha 1 expression in glioblastoma multiforme on prognosis based on bioinformatic analysis

摘要目的 筛选与多形胶质母细胞瘤转移相关的分子标志物,为多形胶质母细胞瘤的早期诊断、预后评估以及药物靶点的研究提供参考.方法 利用多个基因芯片数据库,包括高通量基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)、癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)、用户友好的癌症网络分析工具(User-Friendly Analysis of Cancer Network,UALCAN)、京都基因和基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)、蛋白互作数据库(Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins,STRING)、人类蛋白组学数据库(The Human Protein Atlas,HPA)、基因表达谱交互式分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)进行层黏连蛋白亚基α1(laminin subunit alpha 1,LAMA1)基因关于多形胶质母细胞瘤表达情况深度数据挖掘.结果 检索GEO在GSE179882、GSE137901和GSE184643 3个数据集取交集,得到在多形胶质母细胞瘤组织高差异达基因14个,其中高表达6个,低表达8个.LAMA1基因在多形胶质母细胞瘤中呈高表达.String蛋白互作分析显示,LAMA1与肌营养不良蛋白聚糖1(dystroglycan 1,DAG1)、透明质酸受体(cluster of differentiation 44,CD44)、整合素亚基 βi(integrin subunit beta 1,ITGB1)、层黏连蛋白亚基 βi(laminin subunit beta 1,LAMB1)、层黏连蛋白亚基 y1(laminin subunit gamma 1,LAMC1)、整合素亚基 β2(integrin subunit beta2,ITGB2)、骨巢蛋白 2(nidogen 2,NID2)、整合素亚基 β6(integrin subunit beta6,ITGB6)、层黏连蛋白亚基 α 2(laminin subunit alpha 2,LAMA2)、层黏连蛋白亚基 α5(laminin subunit alpha 5,LAMA5)等蛋白具有相互作用.UALCAN与Kaplan-Meier Plotter生存分析表明,LAMA1基因mRNA高表达患者总体生存率较低,预后更差.KEGG富集分析LAMA1表达与学习、听觉刺激反应、机械刺激反应、学习或记忆、有机羟基化合物跨膜转运蛋白活性密切相关.LAMA1基因与多形胶质母细胞瘤诊断指数具有相关性.结论 LAMA1 mRNA在多形胶质母细胞瘤中高表达,其蛋白与编码蛋白家族可能共同参与了大脑的学习和记忆.LAMA 1 mRNA的高表达与多形胶质母细胞瘤患者的预后相关.LAMA1可以作为多形胶质母细胞瘤的诊断指标.

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作者 李艳玲 [1] 王朝亚 [1] 竺星雪 [1] 刘斌 [1] 学术成果认领
作者单位 安徽卫生健康职业学院,安徽池州 247100 [1]
栏目名称
DOI 10.16241/j.cnki.1001-5914.2025.11.004
发布时间 2025-12-16(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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环境与健康杂志

环境与健康杂志

2025年42卷11期

958-964,封3页

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