换一批反硝化细菌Y39-6的基因组及生理生化特征研究
Study on genome,biological and biochemical characteristics of the denitrifying bacterium Y39-6
摘要菌株Y39-6是从哈尔滨周边地区地下水中分离的一株假单胞菌,具有异养反硝化和自养脱氮能力,由于假单胞菌属内的菌种鉴定存在复杂性,对菌株Y39-6的具体分类仍有争议.通过获得菌株Y39-6的全基因组序列,进行比较基因组学分析,分析了菌株的碳源利用和脂肪酸含量特征,对菌株的生理生化特征进行了系统研究.发现菌株Y39-6与模式菌Pseudomonas veronii CIP 104663T的基因组相似性更高,G+C的含量接近,共有基因数量最多,为368个,碳源利用特征相似,可以确定菌株Y39-6属于Pseudomonas veronii菌种.菌株Y39-6有15个特有基因,主要脂肪酸为C16∶0和C17∶0 cyclo,含量分别为22.05％和21.25％,与Pseudomonas veronii菌种的其他菌株相比,存在明显的特异性.通过以上研究,确定了菌株Y39-6的分类地位和生物学特征,为菌株Y39-6的进一步应用提供了生物学参考依据.
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分类号
Q89（环境生物学）
DOI
10.13482/j.issn1001-7011.2021.06.139
发布时间
2023-08-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（51608149）
黑龙江省自然科学基金项目（LH2019E074）
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