换一批
换一批西藏黑木耳高产菌种不同生长发育时期转录组测序分析
Sequencing analysis of high-yielding strains of Tibet Auricularia auriculata at different growth and development stages
摘要以西藏黑木耳高产菌种子实体为研究对象,为探讨西藏高产菌种子实体3个不同发育阶段的基因表达变化,利用Illumina NovaSeq 6000测序平台对黑木耳子实体幼耳期、成熟期和旺盛期的样品进行转录组测序,并对其差异表达基因进行注释和分析.对黑木耳子实体9个样品的测序共获得 81.93 Gb Clean data,组装后得到 13 765 个 Unigene,28 817 个 Transcript,N50 长度为1 954 bp. GO功能富集分析表明,差异表达基因主要富集在细胞组分和催化分子功能组中.KEGG功能富集分析得出,差异表达基因在碳水化合物代谢(16％)、氨基酸代谢(15％)、脂质代谢(12％)、辅助因子和维生素的代谢(9％)有显著富集.本文筛选出多条与黑木耳子实体不同生长发育阶段有关的代谢途径,包括氨基酸代谢、碳水化合物代谢、脂质代谢以及聚糖的生物合成和代谢等,可为下一步筛选和挖掘有关黑木耳子实体生长发育的功能基因提供重要数据参考,为黑木耳品种改良提供科学依据.
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关键词
黑木耳生长发育转录组测序子实体Auricularia auriculariagrowth and developmenttranscriptome sequencingfruiting body
分类号
Q786
DOI
10.13482/j.issn1001-7011.2022.06.115
发布时间
2023-08-31
基金项目
西藏自治区科技计划项目
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