换一批纤维素产生菌汉氏葡糖醋杆菌HDM1-3全基因组测序分析
Whole genome sequencing analysis of the cellulose-producing strain Komagataeibacter hansenii HDM1-3
摘要为全面了解汉氏葡糖醋杆菌(Komagataeibacter hansenii,K.hansenii)HDM1-3 的发酵特性,为提高纤维素产量提供基因组信息,对其基因组数据进行测序分析.采用PacBio RS Ⅱ平台对该菌株进行全基因组测序,基因组由1 个3 659 612 bp染色体和2 个质粒组成,编码3 820 个蛋白质,含有7 个纤维素合成酶基因.基于16S rRNA的系统发育分析表明了K.hansenii HDM1-3 相对于醋酸杆菌科菌株的进化地位.在基因组中,共注释到碳水化合物活性酶88 个.通过KEGG注释到代谢通路相关基因共 3 132 个,其中碳水化合物代谢相关基因 287 个.通过基因组测序获得了K.hansenii HDM1-3 完整的基因组信息,为改造该菌株提供了基因组学基础.
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关键词
汉氏葡糖醋杆菌HDM1-3细菌纤维素全基因组测序碳水化合物代谢Komagataeibacter hansenii HDM1-3bacterial cellulosecomplete genome sequencecarbohydrate metabolism
分类号
Q933（微生物学遗传学）
DOI
10.13482/j.issn1001-7011.2021.09.169
发布时间
2023-10-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
黑龙江省自然科学基金项目（C2015023）
黑龙江省森林工业总局科技计划项目（sgzjY2015016）
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