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七种药用植物c4h基因密码子偏好性及聚类分析

Codon Usage Bias and Cluster Analysis of c4h Genes in Seven Medicinal Plants

摘要为了深入研究药用植物基因特性,利用CodonW和SPSS18.0软件对丹参、黄芪、黄芩、忍冬、桑树、野甘草、长春花共7种药用植物c4h基因密码子进行偏好性和聚类分析.结果表明:7种药用植物c4h基因的有效密码子数介于46.1~55.92,密码子使用偏好性弱,5种药用植物倾向于GC结尾的密码子,2种倾向于AT结尾的密码子.7种药用植物经聚类分析分为两大类,长春花与黄芪为一大类,另一大类中,丹参与黄芩为一类,野甘草、桑树和忍冬为一类.

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作者 王晖 [1] 高德满 [2] 高妍夏 [1] 李学军 [3] 马博辉 [4] 杨贵明 [1] 学术成果认领
作者单位 承德医学院蚕业研究所,河北省高校特产蚕桑应用技术研发中心,河北承德067000 [1] 锡林郭勒盟第二中学,内蒙古锡林浩特,026000 [2] 承德医学院中药研究所,河北承德,067000 [3] 承德医学院图书馆,河北承德,067000 [4]
分类号 Q949.95
栏目名称 生物技术
DOI 10.11942/j.issn1002-2767.2015.03.0005
发布时间 2015-05-19
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