保山猪和杜×保仔猪MC1R基因型鉴定与分析

Characterization and analysis of MC1R genotype in Baoshan pig and Du×Bao hybrid pig

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摘要为了解释保山猪和杜洛克猪杂交后代出现毛色分离的原因,寻找判定保山猪纯种与否的分子标记,试验采用PCR扩增、分子克隆与多重序列比对技术,对保山猪MC1R基因编码区序列及杜×保仔猪(S1～S6 窝)MC1R基因型进行分析.结果表明:保山猪MC1R基因编码区序列长度为 963 bp,共编码321 个氨基酸.以野猪MC1R基因编码区序列为参考,保山猪存在 5 个SNP 位点,在翻译水平上发生2 个错义突变及3 个同义突变,2 个错义突变为第 283 位碱基由G＞A、第 305 位碱基由T＞C,3 个同义突变为第51 位碱基由G＞A,第363 位碱基由T＞C,第729 位碱基由G＞A,证实调控保山猪黑毛色的等位基因为ED1.S1～S4 窝为纯种的杜×保仔猪,仔猪均为全黑色,在碱基 491C＞T、727G＞A、729C＞A处均存在突变,这3 个SNP位点处图谱均为双峰,基因型为ED1/e;S5 窝为杂种的杜×保仔猪,为黑毛、黄毛仔猪,黑毛仔猪基因型为ED1/e,黄毛仔猪基因型为e/e;S6 窝为杂种的杜×保仔猪,为黑毛及黑黄纵纹仔猪,其基因型均为ED1/e.说明MC1R基因可以作为解释保山猪毛色分离和判断纯种与否的分子标记.