换一批PA3573基因的结构功能预测及其在抗鲎素菌株中表达分析
Prediction of structure and function of PA3573 gene and analysis of its expression in limuloid-resistant strains
摘要铜绿假单胞菌的耐药形势日益严峻,通过耐药泵将药物排出是铜绿假单胞菌产生耐药性的重要原因之一.采用生物信息学方法对PA3573 基因编码蛋白进行结构功能预测以及编码蛋白与鲎素肽分子对接的模拟实验预测,并对PA3573 基因在铜绿假单胞菌抗鲎素突变株中转录表达情况进行分析.结果表明,PA3573 基因编码蛋白是碱性带正电的稳定非分泌的疏水性跨膜蛋白,主要含有α-螺旋结构、无信号肽和21 个潜在的磷酸化位点.PA3573 蛋白含有一个主要协同转运超家族(MFS)保守结构域,属于主要协同转运超家族.该蛋白与DR97-4591 蛋白基因共表达,与阴沟肠杆菌、大肠杆菌等有较近的亲缘关系.研究发现PA3573 基因在不同传代浓度诱导下获得的抗鲎素突变株中均有明显差异表达,且预测该编码蛋白与鲎素通过氢键和疏水作用相结合的方式发挥作用.该结果为进一步阐明PA3573 基因编码蛋白在铜绿假单胞菌中的作用提供一定的理论指导.
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关键词
铜绿假单胞菌PA3573基因结构功能预测表达分析鲎素结合方式Pseudomonas aeruginosaPA3573 genestructure and function predictionexpression analysislim-ulusbinding mode
分类号
Q7（分子生物学）
栏目名称
DOI
10.14140/j.cnki.hncjxb.2023.05.014
发布时间
2023-11-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
河南省自然科学基金面上项目（202300410035）
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