换一批茶树NAC转录因子家族的鉴定及生物信息学分析
Identification and Bioinformatics Analysis of NAC Transcription Factor Family in Tea Tree (Camellia sinensis L.)
摘要利用生物信息学手段对茶树NAC转录因子家族的成员、系统发育、编码蛋白的理化性质和结构以及创伤胁迫处理后的表达进行分析.研究结果显示,茶树NAC转录因子家族包含49个成员,与拟南芥的106个NAC成员构建系统发育进化树,结果显示,茶树缺乏拟南芥NAC家族17个亚族中的第10和第14两个亚族.理化性质和结构分析显示茶树NAC蛋白质绝大多数是亲水氨基酸,二级结构以无规则卷曲为主,三级结构大部分相似.保守基序分析表明,茶树NAC成员共包含7个保守基序,其中基序3、4、2和5、1分别代表NAC结构域的A、B、C和D亚结构域,而基序7表示的是亚结构域E.第15,16和17亚族的大部分成员都缺失了第2和第4两个保守基序,而第15亚族成员具有一个特异的保守基序6.在机械创伤处理条件下表达模式分析表明,第11亚族的CsNAC33和CsNAC34两个成员虽然具有不一样的蛋白结构域组成,但在应对创伤处理时呈现相对一致的表达模式,而16亚族的CsNAC47和CsNAC48两个成员具有一致的蛋白结构域组成,但其表达模式出现分化.上述结果为后续进行茶树NAC基因家族功能的研究提供了理论依据.
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分类号
Q37（植物遗传学）
栏目名称
发布时间
2017-06-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
河南省基础与前沿技术研究计划（162300410257）
河南省产学研合作项目（172107000033）
信阳师范学院青年科研项目（0201425）
信阳师范学院青年骨干教师资助项目（2016GGJS-13）
研究生科研创新项目（2015KYJJ36）
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