换一批大戟科植物鲨烯环氧酶核苷酸及其编码氨基酸序列生物信息学分析
Bioinformatics Analysis of Squalene Epoxidase Coding Gene and Amino Acid Sequence in Euphorbiaceae
摘要鲨烯环氧酶(squalene epoxidase,SQE)是在三萜和甾醇类化合物生物合成通路中的关键酶.主要采用生物信息学方法对17种大戟科植物的SQE核苷酸及其编码氨基酸序列的序列结构、理化特性方面以及空间结构进行了初步预测和分析,并构建SQE蛋白家族的系统进化树.结果表明,17种大戟科植物的SQE氨基酸序列结构与理化性质具有一定差异,多为碱性的疏水性蛋白;多数不具有信号肽,没有导肽分裂位点,却具有导肽,具有0～5个数量不等的跨膜结构域;亚细胞定位预测可能定位在内质网膜、质膜、类囊体膜和线粒体内膜上.SQE二级结构中最主要的结构元件是α螺旋和无规则卷曲,保守区都含有一个PLN02985 superfamily保守结构域,属于鲨烯单加氧酶超家族.分析结果可为SQE的酶学特性及三萜类化合物生物合成的分子机制研究提供理论基础.
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分类号
R931（生药学《天然药物学》）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1004-3918.2019.07.009
发布时间
2019-08-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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