换一批杆状病毒泛素蛋白的序列及分子进化分析
Sequence and Molecular Evolution Analysis of Ubiquitin Proteins Encoded by Baculoviruses
摘要[目的]分析杆状病毒泛素蛋白的序列特征和分子进化.[方法] 运用Clustal W软件进行序列多重联配分析,采用临近法(NJ)和最大简约法(MP)构建系统进化树.[结果] 昆虫杆状病毒泛素与真核生物泛素的一致性为73%～86%,差异体现在氨基酸15～32和53～57的序列上,其他序列高度保守.在真核生物泛素蛋白序列中,许多功能性的氨基酸残基在昆虫杆状病毒泛素蛋白序列中也存在.系统进化分析将昆虫杆状病毒和真核生物泛素蛋白大致分为3个亚家族,即GV族、I族和II族.杆状病毒泛素基因采取负选择的进化方式,在长期的进化过程中,其氨基酸序列倾向于逐渐被固定下来,达功能和结构上的稳定.[结论]分析杆状病毒泛素的序列特征和分子进化,为进一步研究其生物学功能提供参考.
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分类号
S4
DOI
10.3969/j.issn.1009-4229-B.2010.09.015
发布时间
2011-05-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
中国博士后科学基金（(20100471387)）
江苏省高校自然科学基础研究（(07KJB180013)）
江苏大学高级人才基金（(05JDG048)）
Supported by China Postdoctoral Scientific Foundation（(201004713-87)）
Natural Science Foundation for Universities of Jiangsu Province（(07KJB180013)）
Foundation for Talented Man in Jiangsu University（(05JDG048)）
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