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东乡野生稻渐渗系基因组结构变化及多样性分析

Analysis on Genomic Structure Changes and Diversity of Introgression Lines in Dongxiang Wild Rice （Oryza rufipogon Griff.）

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摘要[目的】研究东乡野生稻渐渗系基因组结构变化及对其进行多样性分析。[方法]以东乡野生稻（O．rufipogonGriff．，供体）和栽培稻协青早B（O．sativasp．indicaKato．，受体）构建的Bc，R渐渗群体为研究材料，利用筛选出的分布在12对染色体上的25对SSR引物对群体中的239个株系进行多态性分析。[结果]适25个微卫星位点都有东乡野生稻DNA片段不同程度的渗入，群体均大部分保留亲本协青早B或东乡野生稻的DNA序列。渐渗系基因组中平均受体纯合条带百分率为78．13％，最高达94．98％（引物为RM131），最低为60．25％（引物为RM171）。平均供体纯合条带百分率为13．37％，最高达32．64％（引物为RM171），最低为2．93％（RM1095）。群体中还存在一些杂合位点，平均杂合率为5．62％，最高达10．04％（引物为RM401）。此外，BC1F6渐渗群体中发现有双亲条带的丢失和一些双亲所没有的新条带出现，其中平均亲本条带丢失率为2．88％，最高达13．39％（引物为RM311），最低为0（引物为RM401），平均新带率为1％。高世代渐渗群体平均Mi’s基因多样性（胁）和平均Shannon’s信息多样性指数（Jr）分别为O．276和0．457。[结论]通过远缘杂交渐渗系发生了广泛遗传与表观遗传变异，扩大了遗传变异基础，为水稻品种改良与种质创新奠定了重要基础。