摘要为探究全州禾花鲤乌褐色、半透明的经济体色性状,发掘全州禾花鲤的皮肤基因信息,以全州禾花鲤的皮肤组织为研究对象,利用高通量测序技术进行转录组比较分析.结果显示,全州禾花鲤和建鲤(对照)的皮肤组织转录组测序获得37066778~58708166条clean reads,Q30在94.96%以上,GC碱基比例在51.00%左右;发现新基因10537个,检测出单核苷酸多态性(SNP)位点1278906个、插入缺失(InDel)位点80238个.筛选显著差异基因11717个,其中上调基因5133个,下调基因6584个.GO注释到56个二级分类,显著富集的GO条目127个,主要集中在生物学过程和细胞组分;KEGG分析获得显著富集通路60个;网络分析结果显示,以代谢途径(Metabolic pathways)、p53信号通路(p53 signaling pathway)和细胞周期(Cell cycle)通路作为网络核心,与众多KEGG通路关联且相对独立.
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