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河南省牛至及其近缘种甘牛至SRAP遗传多样性分析与指纹图谱构建

Genetic Diversity Analysis and Fingerprint Construction of Henan Origanum vulgare and Its Related Species Origanum majorana by SRAP Markers

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摘要探讨河南省不同区域分布的牛至(Origanum vulgare)及其近缘种甘牛至(Origanum majorana)遗传多样性和亲缘关系,为牛至及甘牛至种质资源保护、开发利用提供参考.采用相关序列扩增多态性(Sequence-related amplified polymorphism,SRAP)分子标记方法,选取牛至野生居群(7个)、栽培居群(1个)及甘牛至栽培居群(1个)共9个居群77份牛至和甘牛至种质资源进行遗传多样性分析,构建DNA指纹图谱.结果表明,9对引物共扩增出98个条带,多态性条带94条,多态性条带比率为95.92％,平均每对引物扩增出10.89条.等位基因数(Na)为1.959 2、有效等位基因数(Ne)为1.419 5、Nei基因多样性指数(H)为0.263 2、Shannon's指数(Ⅰ)为0.411 9.基于SRAP分子标记数据建立的UPGMA亲缘关系聚类图,遗传相似系数介于0.66～0.95.当遗传相似系数为0.66时,将牛至和甘牛至分为2个单独分支.在遗传相似系数为0.75时,不同区域牛至分为5个分支.综上,SRAP分子标记可以有效鉴别牛至与甘牛至;河南省南阳牛至种群遗传多样性高于其他区域;筛选出了 5对SRAP引物(Me1/em6、Me1/em11、Me3/em4、Me3/em11、Me5/em3)构建牛至和甘牛至种质DNA指纹图谱.