换一批第三代测序细菌基因组DNA提取方法的比较
Comparative Study of Bacterial DNA Extraction Methods for the Third Generation Sequencing Technology
摘要为筛选有效提取细菌菌株总DNA的方法,分别采用SDS法、CTAB-SDS法、试剂盒法和改良试剂盒法对苏云金芽胞杆菌、粘细菌和放线菌进行总DNA的提取、电泳检测、NanoDrop 2000测定、PCR扩增.对放线菌和苏云金芽胞杆菌,用改良试剂盒法所提取的总DNA纯度较高,电泳条带清晰,DNA主带位于23 kb,单位体积菌液所提取到的总DNA较SDS法和CTAB-SDS法高,能满足下游的PCR扩增等分子操作.对待测样品所做的质检报告也证实样品合格,可用于后续建库、测序.而粘细菌提取到的总DNA由于它们的OD260/230在2.0以下,没有达到第三代测序样品的要求.改良试剂盒法所提取到的总DNA大多数可以满足第三代测序技术样品制备的要求.
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关键词
第三代测序技术DNA提取方法CTAB-SDS法改良溶液型试剂盒法The third sequencing technologyDNA extraction methodCTAB-SDS methodimproved solu-tion genomic DNA kit extraction method
分类号
Q939.9（应用微生物学）
栏目名称
DOI
10.7612/j.issn.1000-2537.2015.06.003
发布时间
2016-01-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（31370116）
国家基础研究计划（973;2012CB722301）
国家高技术研究发展计划（863计划）（863;2011AA10A203）
湖南省教育厅重点项目（13CY002, 10CY013,12K033）
湖南省协同创新中心项目（20134486）
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