换一批
换一批新型冠状病毒关键受体ACE2基因启动子的生物信息学分析
Bioinformatics Analysis of ACE2 Gene Promoter Region,SARS-CoV-2 Key Receptor
摘要为探究新型冠状病毒(SARS-CoV-2)关键受体ACE2基因的启动子、CpG岛、转录因子以及SNP位点,从GeneBank数据库获取人ACE2基因组序列和其在染色体的定位信息,并且利用多种生物信息学工具对其上游5'端的启动子、转录因子结合位点、CpG岛、SNP等进行预测和分析.结果表明,人ACE2基因5'调控区2100 bp区域含启动子序列;Promoter 2.0和NNPP数据库推测其区间分别存在1个、2个启动子;AliBaba 2.1和PROMO数据库预测到其启动子保守区域共同的转录因子结合位点为24个;当设置Relative profile score threshold为95％,JASPAR网站预测到7个潜在的转录因子EOMES的结合位点;此外,EMBOSS,MethPrimer及CpG finder均预测存在1个CpG岛,而且位于282～558 bp,大小为277 bp;SNP function prediction还发现了7个SNP位点.本研究将为SARS-CoV-2的疫苗研制和新药开发提供新的思路.
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