白细胞计数异常患者全血基因组DNA提取方法的优化
Optimization of Whole Blood Genomic DNA Extraction Method in Patients with Abnormal White Blood Cell Count
摘要目的 解决白细胞(WBC)计数异常的患者从血液样本中提取基因组DNA较为困难的问题.方法 以需要进行人类白细胞抗原(HLA)基因分型检测的血液样本为研究对象,根据WBC计数,将样本分为WBC计数正常组[WBC计数(4~10)×109 L-1,Normal 组]、低 WBC 计数组(WBC 计数<4×109 L-1,LWBC 组)和高 WBC 计数组(WBC 计数>10× 109 L-1,HWBC 组),LWBC 计数组进一步分为 WBC 计数(1~4)×109 L-1(LWBC1 组)、(0.5~1)×109 L-1(LWBC2组)、(0.1~0.5)×109 L-1(LWBC3组)和<0.1×109 L-1(LWBC4组)4组.DNA提取采用血液基因组柱式小量提取试剂盒,主要在样品处理环节进行优化.以提取DNA的纯度、浓度以及进行后续分型检测结果的准确性为指标,对优化策略进行评估.结果 方法优化后,各组提取的DNA的纯度A260/A280均可维持在1.60~2.00,浓度均值分别为54.33 μg·L-1(Normal 组)、51.50 μg·L-1(LWBC1 组)、53.20 μg·L-1(LWBC2 组)、49.80 μg·L-1(LWBC3 组)、25.80 μg·L-1(LWBC4组)以及54.0 μg·L-1(HWBC组),提取的DNA同一样本分别采用两种方法进行后续HLA基因分型检测,均可顺利完成,且结果一致.结论 可以通过优化,采用全血完成对WBC计数异常的患者进行基因组DNA提取.
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