基于生信分析DPP7在结肠癌中的诊断及预后价值
The diagnostic and prognostic value of DPP7 in colon cancer-a study based on bioinformatics
摘要目的 本文旨在对DPP7基因在结肠癌患者中潜在的诊断和预后意义进行探讨.方法 从TCGA公共数据库中下载结肠癌的相关样本资料,过滤得出包含一般临床信息、分期、预后等相关临床信息的样本资料.首先分析非配对样本中结肠癌组织与正常组织中DPP7基因的表达值之间有无差异,再进行筛选得出包括癌与癌旁组织的结肠癌配对样本,分析配对样本中癌与癌旁组织中DPP7的基因表达有无差异.基于DPP7的基因表达构建出预测结肠癌组织或是正常组织的ROC曲线.比较结肠癌不同肿瘤T、N、M分期中DPP7的表达差别.根据DPP7的基因表达值高低将结肠癌样本分为DPP7高表达组与DPP7低表达组,分析DPP7的高表达与低表达对结肠癌生存预后指标OS、DSS及PFI的影响.最后对DPP7与结肠癌中24种免疫细胞相关性进行分析.结果 无论是非配对样本还是配对样本,DPP7在结肠癌中的基因表达值均较正常组织的表达值显著升高,并且具有统计学差异.通过DPP7在结肠癌中的表达情况构建ROC曲线,其AUC及CI值显示DPP7对结肠癌具有很好的预测作用.DPP7在结肠癌不同肿瘤N、M分期中的表达具有显著差异,且具有统计学意义.存在低表达DPP7的患者具有较好的OS、DSS和PFI.DPP7的表达与结肠癌中多种免疫细胞具有相关性.结论 DPP7有可能成为结肠癌的诊断及预后指标,DPP7与结肠癌中的免疫细胞密切相关,与免疫浸润有关.
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