健脾消渴方干预2型糖尿病大鼠胰腺组织lncRNA-miRNA-mRNA转录网络分析
Analysis of lncRNA-miRNA-mRNA transcription network of pancreatic tissue in type 2 diabetes mellitus rats intervened by Jianpi Xiaoke Formula
摘要目的 研究 2 型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)大鼠经健脾消渴方干预后其胰腺组织的长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)-微小RNA(microRNA,miRNA)-信使RNA(messenger RNA,mRNA)转录网络变化,从转录组学角度探讨健脾消渴方治疗T2DM的作用机制.方法 选用Wistar大鼠,建立T2DM模型.选取造模成功的大鼠给予健脾消渴方干预8周,行空腹血糖(fasting blood glucose,FBG)测定和ELISA法检测空腹胰岛素(fasting insulin,FINS)、血清胰高血糖素(glucagon,GC)以评估疗效.取胰腺组织进行高通量测序,筛选差异表达的lncRNAs、miRNAs及mRNAs;利用生物信息学方法分析药物作用涉及的关键生物学过程和靶点通路.测序结果采用qRT-PCR法验证其准确性.最后构建lncRNA-miRNA-mRNA三元转录网络及蛋白互作网络.结果 健脾消渴方能降低T2DM大鼠FBG、GC水平,升高FINS.根据测序结果,筛选出模型大鼠有385个DE-lncRNAs和492个DE-mRNAs,健脾消渴方治疗后有354个DE-lncRNAs、590个DE-mRNAs和32个DE-miRNA.最终构建的ceRNA网络包含33个DE-lncRNAs、16个DE-miRNAs及87个DE-mRNAs.GO富集分析和KEGG通路分析显示药物干预的靶点可能涉及糖脂代谢等生物功能以及鞘脂代谢、脂肪细胞脂解的调节、FoxO信号通路、PI3K-Akt信号通路等.结论 健脾消渴方可能通过影响T2DM大鼠胰腺组织的lncRNA-miRNA-mRNA转录网络系统改善胰腺功能、调控血糖,转录网络涉及多条通路及多个生物学过程.
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